故事发生在遥远的未来，肆虐的异生兽给人人还是要保留几分脾气，坚守自己的个性，拥有表达真实想法的勇气。有时候，你一味善良迁就、隐忍不言，反而会吃力不讨好，让自己满心委屈。过度迁就他人，本质上就是对自己的苛刻。其实，你最该取悦的人是自己，最该重视的感受也是自己的。类的安全带来了巨大的困扰，为了抵挡异兽的进攻，日本政府成立了防卫组织TLT，其中，夜袭队拥有着最强大的实力和最强劲的武器，是整个组织内部的中坚力量。然而，面对经过了进化的新型异生兽，夜袭队亦束手无策，在这个节骨眼上，光之巨人奈克瑟斯奥特曼和它的适能者姫矢准（桐岛优介 饰）出现了。在奈克瑟斯奥特曼创造出的美塔领域中，奥特曼和异兽之间展开了激烈的斗争。孤门一辉（川久保拓司 饰）是TLT里的新进成员，当他目睹了奈克瑟斯奥特曼强大的力量后，开始对奥特曼的起源和姬矢准的神秘过往产生了兴趣。