人生路上，我们总忙着认识形形色色的人，以为这就是丰富生命。可最有价值的遇见，是在某个瞬间，重新与过去的自己相逢。那一刻才恍然大悟：走遍千山万水，不过是为了找到一条回归本心的路。

娜美偶然得到一张珍兽岛的地图，据说那里埋藏着无价的宝藏，草帽海贼团的诸位不顾乔巴的阻拦，决定向这座小岛挺进。正在此时，海底火山爆发，将黄金梅利号抛向空中。机缘巧合，他们竟然被抛到了珍兽岛。这个小岛由会说人话的动物统治，它们的老国王麒麟狮已经仙逝，偶然跌落于此的乔巴被众兽奉为新的国王。乔巴拗不过众兽，权且任职。正当珍兽岛为新国王的诞生欢欣鼓舞之时，贪婪邪恶的巴特拉伯爵及其爪牙登陆小岛。为了传说中的“国王宝藏”，他不惜对岛上的动物大开杀戒。他们也势必和草帽海贼团发生冲突……

本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2002年上映的第三部动画剧场版。