主角·山本慢慢才明白，人生就像脑电图，波折起伏、崎岖不平。我们需要经历太多风雨，唯有历经世事，才能真正懂得人生的意义；唯有饱经沧桑，内心才会愈发平静；唯有迎难而上，才能变得更加坚强，活得更加精彩。大介在年幼时因飞机失事而流落南美的亚玛逊河流，但奇迹的是他能够靠自己一个人生活下去，更在森林中练就一身钢铁般的身躯。但此时邪恶组织·基度想利用古代印加文明征服世界，为了对抗基度，古代印加文明的承继兼守护者巴哥长老对山本大介施手术，并于左臂殖入印加秘宝叽叽腕轮，将他改造而成的神秘战士蜥蜴改造人·假面骑士亚玛逊。大介之后回到日本欲查明自己身世，进而展开与入侵日本的十面鬼率领之基度组织对抗的命运。